1 Statistiken
- Amtszeit: Juli 2005 – November 2005
- Tage im Amt: 141
- Spiele: 15
- Siege: 4
- Unentschieden: 3
- Niederlagen: 8
- Punkteschnitt:1,00
- Favorisiertes Spielsystem: 4-2-3-1
2 Besondere Ereignisse oder Anekdoten
Als FCK-Trainer sorgte Henke für einen Eklat, als er einen Spieler des Regionalligisten Rot-Weiß Erfurt und dessen Co-Trainer Heiko Nowak als "Scheiß-Ossis" beschimpfte. Henke entschuldigte sich zwar, doch der Thüringer Trainer Pawel Dotschew akzeptierte die Entschuldigung nicht. In der Saison 20/21 sorgte Henke als Verantwortlicher des FC Ingolstadt für einen weiteren Skandal: Nach einem 1:1-Unentschieden gegen den FCK kam es zu einer Auseinandersetzung zwischen Jeff Saibene und Ex-FCK-Trainer Michael Henke. Als sich Saibene zu Schiedsrichter Asmir Osmanagic umdrehte, trat ihm FCI-Sportdirektor Michael Henke, auf den Fernsehbildern deutlich zu sehen, von hinten in die Beine. Während Henke daraufhin schnurstracks die Flucht in die Kabine ergriff, musste der völlig aufgebrachte und wütende Saibene zurückgehalten werden, um Henke nicht zu packen.